Поповкин занял должность руководителя Роскосмоса в апреле 2011 г. Последние два года сопровождались громкими скандалами и резонансными космическими неудачами. В августе 2013 г. чиновник получил выговор от премьер-министра в связи с "ненадлежащим исполнением обязанностей".

После этого стало известно, что вице-премьер Дмитрий Рогозин готовит масштабные чистки в ракетно-космической отрасли. Ожидается, что после увольнения Поповкин займет пост советника Путина по вопросам космоса.